Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDF2Q99470 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SDF2Q99470 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDF2Q99470 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms