Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN18Q96SJ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN18Q96SJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms