Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC43Q96MW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342.2 ms