Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD4Q96M96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD4Q96M96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGD4Q96M96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms