Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf48Q96LS8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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C2orf48Q96LS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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C2orf48Q96LS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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C2orf48Q96LS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2orf48Q96LS8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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