Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALR3Q96L12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALR3Q96L12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms