Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF479Q96JC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms