Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSANTD3Q96H12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD3Q96H12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSANTD3Q96H12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms