Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD4Q96DM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGBD4Q96DM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms