Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NMD3Q96D46 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms