Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTP4Q969X6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms