Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD1Q969G9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKD1Q969G9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms