Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFFLQ8WZ73 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFFLQ8WZ73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFFLQ8WZ73 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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