Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLEC4DQ8WXI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLEC4DQ8WXI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4DQ8WXI8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4DQ8WXI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms