Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX31Q8N9S9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX31Q8N9S9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms