Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC43Q8N309 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC43Q8N309 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms