Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNE4Q8N205 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
SYNE4Q8N205 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNE4Q8N205 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms