Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT78Q8N1N4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT78Q8N1N4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT78Q8N1N4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms