Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00173Q6ZV60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00173Q6ZV60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms