Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRC9Q6ZRR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC9Q6ZRR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRRC9Q6ZRR7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms