Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR88Q6ZMY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms