Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB1D4Q6XE38 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB1D4Q6XE38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB1D4Q6XE38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB1D4Q6XE38 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCGB1D4Q6XE38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms