Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms