Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C3orf33Q6P1S2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms