Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBRD2Q68DH5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBRD2Q68DH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD2Q68DH5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBRD2Q68DH5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBRD2Q68DH5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms