Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP6Q5VW22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP6Q5VW22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP6Q5VW22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms