Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF20Q5VTR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF20Q5VTR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF20Q5VTR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms