Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF648Q5T619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF648Q5T619 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF648Q5T619 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms