Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFYVE27Q5T4F4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFYVE27Q5T4F4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms