Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDYAQ5MJ70 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYAQ5MJ70 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms