Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDRF1Q3B7T1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDRF1Q3B7T1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms