Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP5B1Q2VPB7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP5B1Q2VPB7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP5B1Q2VPB7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms