Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ME3Q16798 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ME3Q16798 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME3Q16798 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME3Q16798 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME3Q16798 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME3Q16798 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME3Q16798 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME3Q16798 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME3Q16798 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ME3Q16798 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME3Q16798 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME3Q16798 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME3Q16798 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME3Q16798 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME3Q16798 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME3Q16798 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME3Q16798 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME3Q16798 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ME3Q16798 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ME3Q16798 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ME3Q16798 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ME3Q16798 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ME3Q16798 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ME3Q16798 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ME3Q16798 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ME3Q16798 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ME3Q16798 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ME3Q16798 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ME3Q16798 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ME3Q16798 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ME3Q16798 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ME3Q16798 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ME3Q16798 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ME3Q16798 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ME3Q16798 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ME3Q16798 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ME3Q16798 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ME3Q16798 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ME3Q16798 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ME3Q16798 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ME3Q16798 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ME3Q16798 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ME3Q16798 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ME3Q16798 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ME3Q16798 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ME3Q16798 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ME3Q16798 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ME3Q16798 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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