Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1EQ15878 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms