Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TWIST1Q15672 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWIST1Q15672 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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TWIST1Q15672 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TWIST1Q15672 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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