Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYR3Q15413 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RYR3Q15413 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RYR3Q15413 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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