Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN1Q15223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NECTIN1Q15223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECTIN1Q15223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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