Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 TP73-AS1-201ENST00000418088 3329 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NARS-204ENST00000586807 1608 ntTSL 213.49□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 212.55□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 GNPDA1-202ENST00000500692 2319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC10.96□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NARS-210ENST00000589314 1036 ntTSL 59.8□□□□□ -0.843e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.939e-12■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.993e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 NOLC1-206ENST00000477977 660 ntTSL 37.09□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 EIF5B-202ENST00000470023 2331 ntTSL 25.9□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 FBXW7-213ENST00000605042 671 ntTSL 35.44□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 22.7
NOLC1Q14978 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.095e-13■■■■□ 22.6
NOLC1Q14978 SNHG14-222ENST00000557108 3210 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 22.6
NOLC1Q14978 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.811e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 520.25■□□□□ 0.831e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 515.5■□□□□ 0.071e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-218ENST00000512507 10982 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.641e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-205ENST00000451949 1744 ntTSL 210.11□□□□□ -0.791e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 H2AFY-216ENST00000511494 2521 ntTSL 29.06□□□□□ -0.961e-19■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.827e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 XIST-202ENST00000417942 724 ntTSL 37.39□□□□□ -1.237e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.427e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.487e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 XIST-203ENST00000421322 446 ntTSL 24.17□□□□□ -1.747e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 MSH5-SAPCD1-205ENST00000476085 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.39□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 22.5
NOLC1Q14978 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.366e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-226ENST00000631619 2457 ntTSL 521.4■■□□□ 1.026e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.466e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-216ENST00000475298 2362 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-216ENST00000555533 1605 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-217ENST00000555640 2887 ntTSL 513.93□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-222ENST00000556733 510 ntTSL 513.91□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 PPID-201ENST00000307720 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-224ENST00000557550 1529 ntTSL 512.32□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-211ENST00000554849 915 ntTSL 511.28□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-203ENST00000553389 952 ntTSL 210.62□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-218ENST00000476744 1029 ntTSL 28.79□□□□□ -16e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 METTL17-208ENST00000554354 249 ntTSL 57.46□□□□□ -1.226e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-215ENST00000474539 4799 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.586e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-204ENST00000464316 3843 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.656e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CCNL1-214ENST00000471247 3671 ntTSL 1 (best)3.29□□□□□ -1.886e-7■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CPPED1-204ENST00000539677 568 ntTSL 214.71□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.4
NOLC1Q14978 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 21e-6■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 223.89■■□□□ 1.412e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 220.16■□□□□ 0.822e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 518.97■□□□□ 0.632e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.052e-16■■■■□ 22.3
NOLC1Q14978 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 520.38■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 22.2
NOLC1Q14978 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-7■■■■□ 22.2
NOLC1Q14978 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 521.31■■□□□ 17e-7■■■■□ 22.2
NOLC1Q14978 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.827e-7■■■■□ 22.2
NOLC1Q14978 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.325e-15■■■■□ 22.2
NOLC1Q14978 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.283e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.493e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 DYNC1H1-208ENST00000556139 763 ntTSL 315.89■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 HLA-B-254ENST00000497377 917 nt12.55□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 HLA-B-253ENST00000481849 753 nt9.81□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-206ENST00000554541 925 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 28.61□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 22.1
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