Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLS1Q14651 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PLS1Q14651 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLS1Q14651 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PLS1Q14651 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLS1Q14651 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLS1Q14651 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLS1Q14651 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLS1Q14651 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLS1Q14651 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLS1Q14651 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLS1Q14651 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLS1Q14651 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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