Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCL1Q14515 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCL1Q14515 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPARCL1Q14515 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPARCL1Q14515 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPARCL1Q14515 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPARCL1Q14515 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPARCL1Q14515 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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