Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKG1Q13976 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKG1Q13976 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKG1Q13976 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms