Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIAQ12857 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIAQ12857 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFIAQ12857 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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