Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms