Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CGNL1Q0VF96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms