Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLFN5Q08AF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLFN5Q08AF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLFN5Q08AF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms