Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CALD1Q05682 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALD1Q05682 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CALD1Q05682 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALD1Q05682 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms