Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAV1Q03135 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV1Q03135 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms