Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL6Q02878 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms