Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROR1Q01973 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROR1Q01973 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROR1Q01973 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms