Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX1Q01196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1Q01196 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX1Q01196 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX1Q01196 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms